Quando si aggiunge un account POP3, è possibile associare una cartella esistente (ad esempio, quella della propria casella postale) all'account o creare una nuova cartella. Quando si scaricano le e-mail dall'account POP3 su GroupWise, queste vengono eliminate dal server POP3. È possibile scegliere di avere gli elementi dei conti POP3 memorizzati sul server POP3. Se si memorizzano gli elementi sul server, è possibile leggerli da più di un computer.