Per istruzioni su come sincronizzare i segnalibri di Internet Explorer, i database Palm Desktop e Lotus* Notes*, vedere la Guida di iFolder 2.1 per l'utente finale.
Non tentare di sincronizzare l'archivio GroupWise® impostandone il percorso nell'ubicazione della directory iFolder. In tal caso il client iFolder danneggerebbe l'archivio GroupWise. Ciò si verifica in quanto iFolder non sincronizza i file come gruppo ma come porzioni di file modificate, mentre i file dell'archivio GroupWise devono essere gestiti come gruppo di file.
Questo problema è stato rilevato per GroupWise; tuttavia, è possibile che si verifichino problemi analoghi con qualsiasi database implementato come gruppo di file collegati.