此章節將帶您了解更重要的指令。本章節列示很多指令。除了列示個別指令、參數之外，會在適當之處，介紹典型的範例應用程式。若要深入了解各種指令，請使用 man 後加上指令名稱，取得並使用手冊頁，例如，man ls。
在 man 頁面，使用 PgUp 和 PgDn，上下移動。使用 Home 和 End，在文件的開頭和結尾之間移動。按 Q 結束此檢視模式。使用 man man，可詳細瞭解 man 指令本身的資訊。
在以下的介紹中，個別指令元素會以不同的字體表示。實際的指令以及它的必要選項，永遠會列印成指令選項。不要求一定要放在 [方括號] 中的規格或參數。
視您的需要調整設定。如果沒有名稱為 file 的檔案存在，就不需要寫入 ls file。您通常可以結合數個參數，例如使用 ls -la 而不是 ls -l -a。
下節列出最重要的檔案管理指令。其中涵蓋一般檔案管理以及檔案系統 ACL 的操作。
如果您執行 ls 而未加上任何其他參數，程式會以簡要格式，列示所在目錄的內容。
詳細清單
顯示隱藏的檔案
複製來源到目標。
在現有目標被覆寫之前，視需要等候確認
循環複製 (包括子目錄)
複製來源到目標，然後刪除原始的來源。
移動前先建立來源的備份副本
覆寫現有的 targetfile 之前，等候確認 (若有需要)
從檔案系統移除指定的檔案。除非使用選項 -r，否則 rm 無法移除目錄。
刪除任何現有的子目錄
刪除每一個檔案前，等候確認
建立從來源到目標的內部連結。通常，這種連結會直接指向同一檔案系統上的來源。不過，如果執行 ln 時使用 -s 選項，它會建立符號連結，只會指向來源所在的目錄位置，提供跨檔案系統的連結功能。
建立符號連結
切換目前的目錄。cd 未加任何參數可以切換到使用者的主目錄。
建立新目錄。
如果指定的目錄已經是空的，則會刪除該目錄。
將檔案的擁有權轉移給具有指定的使用者名稱的使用者。
變更所有子目錄中的檔案與目錄
將指定檔案的群組擁有權，移交至指定的群組。如果成員屬於目前群組和新群組，則檔案擁有者只可以變更群組擁有權。
變更存取許可權。
模式 參數具有三個部份：群組、存取，與存取類型。 group 可接受下列字元：
使用者
群組
其他
至於 access，使用 + 可授與存取權，使用 - 則可拒絕授與權限。
access type 將提供下列控制選項：
讀取
寫入
執行—執行檔案或變更至目錄
Setuid 位元—應用程式或程式可以依照檔案擁有者方式，進行啟動
做為替代方法，可以使用數字程式碼。此程式碼的四個位數組成值 4、 2 和 1 的總合—二進位遮罩的十進位結果。第一個位數會設定使用者 ID (SUID) (4)，設定群組 ID (2) 以及黏貼 (1) 位元。第二個位數定義檔案擁有者的許可權。第三個位數定義群組成員的權限，最後的位數會設定所有其他使用者的許可權。讀取許可權設成 4，寫入許可權設成 2，而執行檔案許可權設成 1。檔案的擁有者一般的執行檔案許可權是 6 或 7。
此程式會使用複雜算術演算法來壓縮檔案內容。用此方法壓縮的檔案，其副檔名是 .gz，而且使用前必須解壓縮。若要壓縮多個檔案或整個目錄，請使用 tar 指令。
解壓縮包裝的 gzip 檔案，如此它們會恢復成原始大小而且可以正常處理 (和指令 gunzip 類似)。
tar 將一或多個檔案放到歸檔。壓縮是選擇性的，tar 是相當複雜的指令，有多個選項可用。最常用的選項是：
通常用來將輸出寫入檔案而不是螢幕
建立新的 tar 歸檔
新增檔案至現有的歸檔
輸出歸檔的內容
但是只有在檔案比已包含在歸檔中的檔案更新時，才新增檔案
解開歸檔的檔案 (擷取)
使用 gzip 包裝產生的歸檔
使用 bzip2 壓縮產生的歸檔
列示處理的檔案
由 tar 建立，且副檔名是 .tar 的歸檔檔案。如果 tar 封存也使用 gzip 壓縮，則副檔名是 .tgz 或 .tar.gz。如果它使用 bzip2 壓縮，則副檔名是 .tar.bz2。
這個指令只有在您已經安裝 findutils-locate 套件時才可使用。locate 指令可以尋找指定檔案的所在目錄。若有需要，請使用萬用字元來指定檔案名稱。程式執行速度非常快，因為它使用針對這個目的而建立的資料庫 (不必搜尋整個檔案系統)。然而此現象也會導致一項重大缺點：locate 無法找到資料庫最後更新之後所建立的所有檔案。資料庫可以由root 使用 updatedb 來產生。
此指令會更新 locate 所使用的資料庫。要在現有目錄包括檔案，請以 root 身份執行程式。加上 &，將它放到背景也是好的方法，如此您可以立即繼續在同一個指令行工作 (updatedb &)。這個指令通常當成每日 cron 工作 (請參閱 cron.daily) 來執行。
使用 find，搜尋指定目錄中的檔案。第一個引數會指定從什麼目錄開始搜尋。選項 -name 的後面必須有一個搜尋字串，搜尋字串也可以包含萬用字元。不同於使用資料庫進行搜尋的 locate，find 會掃描實際目錄。
使用 file 可以偵測指定檔案的內容。
可用來嘗試檢視壓縮檔案中的內容
cat 指令可在不中斷的前提下顯示檔案的內容、列印整個內容至螢幕。
在輸出的左邊界加上編號
此指令可以用來瀏覽指定檔案的內容。使用 PgUp 和 PgDn 向上或向下捲動螢幕的一半頁面，或者使用空格鍵捲動整個螢幕頁面。使用 Home 和 End 移至檔案的開頭或結尾。按 Q 結束程式。
grep 指令可以在指定檔案中搜尋特定的搜尋字串。如果找到搜尋字串，指令會顯示所找到出淚搜尋字串的一行文字以及檔案名稱。
忽略大小寫
只顯示相關檔案的名稱，不是文字行
另外顯示發現符合資料的行數
只列示沒有出淚搜尋字串的檔案
diff 指令會比較任何兩個檔案的內容。程式產生的輸出，會列示不相符的所有行。只需要傳送程式變動的地方，而不是整個原始程式碼的程式設計人員經常使用此指令。
只報告兩個檔案是否不同
產生 制式
差異，使輸出更方便閱讀
此指令可以用來裝載任何資料媒體，例如硬碟、CD-ROM 光碟機以及其他磁碟機至 Linux 檔案系統的目錄。
唯讀裝載
指定檔案系統，通常 ext2 代表 Linux 硬碟、msdos 代表 MS-DOS 媒體、vfat 代表 Windows 檔案系統、iso9660 代表 CD
至於未定義在檔案 /etc/fstab 中的硬碟，也必須指定裝置類型。在此狀況下，只有 root 可以裝載它。如果要讓其他使用者也能裝載該檔案系統，請在 /etc/fstab 的適當行，輸入選項 user (用逗點分開) 並儲存所做的變更。如需更多詳細資訊，請參閱 mount(1) man 頁面。
此指令會檔案系統中的已裝載磁碟機解除裝載。要防止資料遺失，從磁碟機取出抽取式資料媒體前，執行此指令。一般情況下，只有 root 可以執行 mount 與 umount 這兩個指令。若要讓其他使用者執行這些指令，請編輯 /etc/fstab 檔案，為相關的磁碟機指定選項 user。
下節列出一些擷取系統資訊以及控制程序和網路時最重要的指令。
df (磁碟可用空間) 指令，在未加上任何選項時，會顯示所有磁碟空間的資訊、目前使用的磁碟空間以及所有裝載磁碟機的可用空間。如果指定目錄，只會顯示該目錄所在磁碟機的資訊。
顯示佔用的區塊數目 (GB、MB 或 KB)—以人類可判讀的格式。
檔案系統的類型 (ext2、nfs 等等)
在執行時未加上任何參數，此指令會顯示目前目錄的檔案和子目錄所佔用的總磁碟空間。
顯示每一個別檔案的大小
人類可判讀之格式的輸出
只顯示計算的總共大小
指令 free 會顯示關於 RAM 以及交換空間使用的相關資訊，顯示二者類別的總計以及使用總數。如需相關資訊，請參閱節 19.1.6, free 指令。
以位元組為單位的輸出
以 KB 為單位的輸出
以 MB 為單位的輸出
此簡單程式會顯示目前的系統時間。如果以 root 的身分執行，它也可以用來變更系統時間。如需有關此程式的詳細資料，請參閱 date(1) man 頁面。
top 提供目前執行程序的快速概觀。按 H 存取頁面，簡略說明主要選項來自定程式。
如果執行時不加任何選項，此指令會顯示由您啟動的程式或程序的相關表格。此指令的選項前面不會加上連字號。
顯示所有程序的詳細清單，與擁有者無關
不幸地，有時候程式無法以正常方式終止。大部份情況下，您仍然可以指定相關的程序 ID 來執行 kill 指令，以便停止執行中的程式 (請參閱top 和 ps)。kill 會傳送 TERM 訊號，指示程式關閉自已。如果此指令沒有作用，可以使用以下參數：
傳送 KILL 訊號而非 TERM 訊號，這時多半可結束所指定的程序。
此指令類似 kill，但是使用程序名稱 (而非程序 ID) 做為引數，刪除所有該名稱的處理程序。
ping 指令是標準工具，用於測試 TCP/IP 網路的基本功能。它會傳送小的資料封包至目的地主機，要求立即回應。如果有作用，ping 會顯示訊息，指示網路連結基本上是正常的。
決定要傳送的封包總數，並在分派後結束 (依預設，沒有限制設定)
flood ping：儘可能傳送很多資料封包，一種常用方法，保留給 root 來測試網路
指定兩個資料封包之間的時間間隔 (秒) (預設值：1 秒鐘)
網域名稱系統會將網域名稱解析成 IP 位址。使用此工具，傳送查詢至名稱伺服器 (DNS 伺服器)。
Telnet 實際上是一種網際網路通訊協定，供您透過網路在遠端主機上工作。Telnet 也是使用這種通訊協定的 Linux 程式名稱，用來在遠端電腦進行作業。
警告： 不要在第三方可以監聽的網路上使用 telnet。
特別是在網際網路上，使用加密傳送的方法，例如 ssh，防止密碼被惡意使用的危險 (請參閱 ssh 的手冊頁)。
使用者可以使用此指令，在任何時候變更他們自己的密碼。管理員 root 可以使用此指令，變更系統上任何使用者的密碼。
su 指令可以從執行中的工作階段改用不同的使用者名稱登入。指定使用者名稱和相關密碼。將不會要求 root 的密碼，因為 root 己授權為可以使用任何使用者的身份。使用此指令時如果未指定使用者名稱，系統將提示您輸入 root 密碼並變更為超級使用者 (root)。
使用 su -，為不同使用者啟動登入外圍程序
若要避免遺失資料，應該永遠使用這個程式關閉系統。
功能相同於 halt，只是系統會立即重新啟動。
此指令會清除主控台的可見區域。它沒有任何選項。
本章節列示很多指令。如需關於其他指令或更詳細的資訊，建議參閱 O'Reilly 出版的《Linux in a Nutshell》。