En los sistemas operativos Windows 2000 Server puede producirse el problema siguiente:
Si los servicios de instalación remota están instalados en Windows 2000 Server, SIS (Single Instance Store) también lo estará. El controlador de SIS (SIS.SYS) entra en conflicto con el controlador del filtro del Cliente iFolder (NIFFLTR.SYS). Debe desinstalar uno de estos dos programas. En caso contrario, las estaciones de trabajo de los usuarios no se reiniciarán durante la instalación del Cliente iFolder y aparecerá un mensaje de error que advierte del conflicto por la existencia de ambos controladores.